El clima en Sipadan y en las islas cercanas es caluroso y soleado durante todo el año.
La zona de Sipadan goza de una refrescante brisa marina y de lluvias aisladas.
Temperatura media: 30-32°C
Temperatura del agua: 27-30°C
Temporada de Buceo
Sin tifones ni monzones, la temporada de buceo en Sipadan es todo el año y las mejores conciones son entre Marzo y Octubre.